物理和化學凈化的三個主要類別是熱，液體消毒以及蒸汽和氣體

熱：濕熱是zui可靠的滅菌方法。高壓滅菌（在大約15 psi的壓力下飽和蒸汽，在規定的時間內達到至少250°F的腔室溫度）是迅速破壞所有形式的微生物生命的zui佳方法。

• 除了適當的溫度和時間以外，由于空氣的熱傳遞特性差，防止夾帶的空氣對于實現無菌性也至關重要。
• 要滅菌的材料必須與蒸汽和熱接觸。必須在每次加載時使用正確的高壓滅菌器指示器（例如，高壓滅菌器膠帶或高壓滅菌器敏感標簽），以直觀地指示處理成功。
• 僅使用高壓滅菌帶不足以監測滅菌的成功。
• 馬薩諸塞州公共衛生部《醫療廢物管理法》對用于醫療廢物滅菌的高壓滅菌器有特定的質量控制要求。附錄D：高壓滅菌器質量保證計劃描述了此類測試的程序。

液體消毒：液體消毒劑（例如，zui終漂白劑濃度為0.5％的家用漂白劑的1:10溶液）用于擦拭或浸泡可能受污染的材料一段時間，以殺死所有存在的病原體。每種消毒劑需要不同的接觸時間。

氣體和蒸氣：潛在污染的物品暴露于滅菌氣體（例如，環氧乙烷或ETO）或來自化學品的蒸汽（例如，甲醛）中。由于所用氣體和蒸氣的危險性，因此需要專門設計的設備和設施。